เมื่อเวลาประมาณ 21.20 น. วันที่ 16 กันยายน 2549 ได้เกิดเหตุระเบิดในตัวเมืองหาดใหญ่ จังหวัดสงขลา 6 จุด ในเวลาไล่เลี่ยกัน โดยที่บริเวณหน้าห้างโอเดียน ช็อปปิ้ง มอลล์ เกิดเหตุระเบิด 3 จุด จุดที่ 4 ที่บริเวณห้างสรรพสินค้าและโรงแรมลีการ์เด้นส์ พลาซ่า ทั้ง 2 ห้าง ตั้งอยู่ในย่านดาวน์ทาวน์ใจกลางเมืองหาดใหญ่ จุดที่ 5 ห้างไดอาน่า จุดที่ 6 บริเวณห้างบิ๊กซี บริเวณชานเมือง ในเขตเทศบาลนครหาดใหญ่ หลังเกิดเหตุเจ้าหน้าที่ได้ตัดสัญญาณโทรศัพท์มือถือทุกระบบทันที
ต่อมา เวลา 23. 00 น. เศษ วันเดียวกัน นายแพทย์
พล.ท.
"เราหารือกับทุกหน่วยงานที่เกี่ยวข้องมาตลอด โดยให้ความสำคัญกับพื้นที่หาดใหญ่อย่างต่อเนื่อง มีการปรึกษากับผู้ว่าราชการจังหวัดสงขลา และผู้บัญชาการตำรวจภาค 9 เพราะเกรงจะกระทบภาพลักษณ์ของการท่องเที่ยว เมื่อเกิดเหตุการณ์อย่างนี้ต้องยอมรับว่า กระทบกับการท่องเที่ยวเมืองหาดใหญ่แน่นอน" พล.ท.องค์กรกล่าวและว่า
พล.ท.องค์กร กล่าวว่า ตนต้องขอความร่วมมือพี่น้องประชาชนในพื้นที่ ช่วยกันเป็นหูเป็นตาช่วยเฝ้าระวัง แจ้งเบาะแส หรือให้ข้อมูลบุคคลที่มีลักษณะแปลกปลอมเข้ามาในพื้นที่ ในส่วนของเจ้าหน้าที่คงจะต้องทบทวนมาตรการให้รัดกุมยิ่งขึ้น