โดยศูนย์ดังกล่าวมีผู้ว่าราชการจังหวัดสงขลา เป็นผู้อำนวยการ มีคณะกรรมการอำนวยการประกอบด้วย รองผู้ว่าราชการจังหวัด ผู้บังคับการตำรวจภูธรจังหวัด รวมถึงหัวหน้าส่วนราชการต่างๆ ในจังหวัดสงขลาที่เกี่ยวข้อง  ทำหน้าที่อำนวยการ ประสาน เร่งรัด การดำเนินการช่วยเหลือเยียวยาผู้ได้รับผลกระทบจากการก่อความไม่สงบของส่วนราชการ และหน่วยงานภาคเอกชนที่เกี่ยวข้อง

นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นศูนย์กลางในการติดต่อสื่อสารและประสานงานกับส่วนราชการและหน่วยงานภาครัฐ ภาคเอกชน ตลอดจนแถลงข่าวต่อสื่อมวลชนเพื่อให้ข้อเท็จจริงต่างๆ เกี่ยวกับการดำเนินการช่วยเหลือแก่ผู้ได้รับผลกระทบจากเหตุการณ์ความไม่สงบที่อาจเกิดขึ้นด้วย