กรณีการหลุดรอดของมะละกอจีเอ็มโอไปในสิ่งแวดล้อมเป็นข่าวมาตั้งแต่เดือนก.ค.47 เมื่อกรีนพีซในชุดอวกาศสีขาวได้บุกเข้าไปทำลายมะละกอจีเอ็มโอในแปลงทดลองของสำนักวิจัยและพัฒนาการเกษตรเขตที่ 3 ส่วนแยกพืชสวน จ.ขอนแก่น เนื่องจากพบการปนเปื้อนของมะละกอจีเอ็มโอในเมล็ดพันธุ์ที่สำนักวิจัยฯ แจกจ่ายให้เกษตรกรกว่า 2,600 ราย

จากนั้นกรมวิชาการเกษตรได้ทำการตรวจสอบ และยอมรับว่ามีการปนเปื้อนจริง โดยล่าสุดได้ให้ข้อมูลว่าทำลายต้นมะละกอในแปลงเกษตรกรที่ตรวจพบจีเอ็มโอไปแล้ว 83 ราย จากนั้นได้ตั้งคณะกรรมการตรวจสอบเรื่องดังกล่าวขึ้นมา 2 ชุดเพื่อตรวจสอบการหลุดรอด และตรวจสอบการยื่นคำขอจดสิทธิบัตรมะละกอจีเอ็มโอของสหรัฐอเมริกา

อย่างไรก็ตาม ในส่วนของการบุกเข้าแปลงทดลองของสำนักวิจัยฯ ที่ขอนแก่นของกลุ่มกรีนพีซ จนก่อให้เกิดข่าวคึกโครมนั้น กรมวิชาการเกษตรได้ฟ้องดำเนินคดีกับกลุ่มกรีนพีซข้อหาทำให้ทรัพย์สินของราชการได้รับความเสียหาย โดยศาลจังหวัดขอนแก่นจะนัดสืบพยานอีกครั้งในวันที่ 30 ก.ย.นี้

ในด้านนโยบายเกี่ยวกับจีเอ็มโอในประเทศไทย ขณะนี้กล่าวได้ว่ายังไม่มีความชัดเจน โดยก่อนหน้านี้คณะกรรมการเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติเคยเสนอนโยบายให้สังคมมีทางเลือกที่จะทดลองพืชจีเอ็มโอในระดับไร่นาและเลือกใช้จีเอ็มโอที่ผ่านการประเมินความปลอดภัยต่อผู้บริโภคและสิ่งแวดล้อมได้ แต่จากกระแสการคัดค้านอย่างกว้างขวางขององค์กรพัฒนาเอกชนและเครือข่ายเกษตรกร ทำให้ที่ประชุมคณะรัฐมนตรี (ครม.) เมื่อวันที่ 31 ส.ค.47 ถอดวาระการพิจารณาข้อเสนอของคณะกรรมการเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติออก

และนายกรัฐมนตรีได้สั่งการตั้งคณะกรรมการเพื่อศึกษาเรื่องนี้ โดยให้ที่ประชุมอธิการบดี (ทปอ.) ตั้งตัวแทนจากคณะวิทยาศาสตร์มาหารือแนวนโยบายที่ควรจะเป็นร่วมกัน จนถึงตอนนี้ยังไม่มีการประกาศความคืบหน้าของนโนบายอย่างเป็นทางการแต่อย่างใด